Constitué depuis la création de l'agence, le fonds documentaire de l’Apur est dédié aux évolutions urbaines, sociales et économiques de Paris dans son contexte francilien et en comparaison avec les autres grandes métropoles européennes et internationales.
Le fonds iconographique conservé par l’Apur concerne essentiellement Paris et couvre la période de 1970 à nos jours. Riche de 20 000 documents numériques (photos, cartes, plans, études…), une sélection du fonds argentique sera prochainement numérisée.